אסטקסנטין הוא פיגמנט אדום שקיים באורגניזמים טבעיים רבים.אסטקסנטין טבעינמצא בעיקר באורגניזמים ימיים השונים מכלורופיל β-קרוטן בצמחים יבשתיים. זוהי צורה של microalgae כי הוא נצרך על ידי סוגים רבים ושונים של אורגניזמים ימיים. הפיגמנטציה האדומה החזקה של אסטקסנטין גורמת לבעלי חיים אלה להיות בעלי בשר אדום או ורוד או קונכיות.
סלמון אדום שנמצא באוקיינוס השקט הפראי הוא אחד הריכוזים הגבוהים ביותר שלאסטקסנטין טבעילמעט ה. פלוביאליס., פיגמנט זה מעניק לבשר הדג סגולות אדומות עמוקות ונוגדות חמצון בריאות להפליא. מקורות טבעיים אחרים של אסטקסנטין כוללים לובסטר, חסילונים ארקטיים, סרטנים, סרטנים, פורל אדום, אצות וקריל. ציפורים אדומות בדרך כלל מקבלות את צבען על ידי אכילת דגים וצמחים עשירים באסטקסנטיןאך ריכוזי הפיגמנטים שלהם נמוכים בדרך כלל.,
למרות שחיים ימיים הם המקור הנפוץ ביותר שלאסטקסנטין טבעיהוא אינו מוגבל לצמחים ובעלי חיים על בסיס מים., לדוגמה, שמרים בשם Xanthophyllomyces dendrorhous (שמרי Phaffia) מכילים גם רמות גבוהות יחסית של אסטקסנטין. זה יצרן של אסטקסנטין. הוא לא יספוג אותו ממקורות אורגניים אחרים.
